Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFYVE27Q5T4F4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFYVE27Q5T4F4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms