Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWL7

PRAMEF14, PRAME family member 14, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF14Q5SWL7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF14Q5SWL7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF14Q5SWL7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms