Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PERM1Q5SV97 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERM1Q5SV97 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PERM1Q5SV97 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms