Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAX1Q5SQQ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAX1Q5SQQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms