Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SAMD9Q5K651 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SAMD9Q5K651 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
SAMD9Q5K651 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms