Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHLRC3Q5JS37 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHLRC3Q5JS37 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms