Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK2Q5EBM0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK2Q5EBM0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK2Q5EBM0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK2Q5EBM0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CMPK2Q5EBM0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CMPK2Q5EBM0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms