Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TDRD12Q587J7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TDRD12Q587J7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms