Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KLHL22Q53GT1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KLHL22Q53GT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms