Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYTL3Q4VX76 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYTL3Q4VX76 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms