Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRNQ4KMQ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRNQ4KMQ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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