Protein–RNA interactions for Protein: Q49B96

COX19, Cytochrome c oxidase assembly protein COX19, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX19Q49B96 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COX19Q49B96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms