Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRY2Q49AN0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRY2Q49AN0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRY2Q49AN0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms