Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms