Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EDRF1Q3B7T1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms