Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC4A8Q2Y0W8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC4A8Q2Y0W8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms