Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL38Q2WGJ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms