Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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