Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KNOP1Q1ED39 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KNOP1Q1ED39 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
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