Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GEN1Q17RS7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GEN1Q17RS7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
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