Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR2Q16832 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDR2Q16832 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDR2Q16832 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms