Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTN1Q16799 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RTN1Q16799 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RTN1Q16799 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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