Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMN1Q16637 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMN1Q16637 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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