Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CRY1Q16526 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRY1Q16526 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRY1Q16526 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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