Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNGA3Q16281 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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