Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZIC1Q15915 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZIC1Q15915 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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