Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CACNA1EQ15878 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CACNA1EQ15878 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms