Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85BQ15834 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC85BQ15834 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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