Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPTX1Q15818 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPTX1Q15818 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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