Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ALX1Q15699 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ALX1Q15699 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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