Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS6KA1Q15418 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPS6KA1Q15418 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms