Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCOLCEQ15113 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCOLCEQ15113 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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