Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HERC3Q15034 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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