Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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LAPTM4AQ15012 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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LAPTM4AQ15012 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LAPTM4AQ15012 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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