Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX2Q14781 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX2Q14781 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX2Q14781 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CBX2Q14781 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CBX2Q14781 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX2Q14781 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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