Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF235Q14590 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF235Q14590 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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