Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEMA3AQ14563 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEMA3AQ14563 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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