Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD9Q14511 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD9Q14511 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEDD9Q14511 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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