Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBI3Q14213 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBI3Q14213 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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