Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPIDRQ14159 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SPIDRQ14159 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPIDRQ14159 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPIDRQ14159 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPIDRQ14159 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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