Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CNGB1Q14028 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
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CNGB1Q14028 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
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CNGB1Q14028 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CNGB1Q14028 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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