Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CKAP5Q14008 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CKAP5Q14008 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CKAP5Q14008 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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