Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2H3Q13889 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2H3Q13889 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms