Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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ITGA9Q13797 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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ITGA9Q13797 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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ITGA9Q13797 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA9Q13797 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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ITGA9Q13797 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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ITGA9Q13797 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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ITGA9Q13797 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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ITGA9Q13797 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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ITGA9Q13797 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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ITGA9Q13797 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA9Q13797 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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