Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTR4Q13639 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HTR4Q13639 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
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