Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUL1Q13616 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CUL1Q13616 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms