Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CAMK2BQ13554 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAMK2BQ13554 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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