Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
BFSP2Q13515 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BFSP2Q13515 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms