Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SF3B2Q13435 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SF3B2Q13435 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms