Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNTA1Q13424 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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