Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB3BPQ13352 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB3BPQ13352 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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