Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ST3GAL4Q11206 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ST3GAL4Q11206 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms